啤酒杀菌的目的是保证啤酒长期保存的生物稳定性。
巴氏杀菌是迄今为止最常见的消毒方法，由法国科学家 Louis D. 发明，由巴斯德 (1822-1895) 发明。啤酒的杀菌温度一般为60~62C，时间为10~20min。如果温度只是稍微升高，杀死微生物所需的时间就会呈指数下降。温度越高，杀菌时间越短。对于50℃以上的杀菌温度，每升高7℃，杀菌时间可缩短9/10，即在相同杀菌时间下，温度每升高7℃，杀菌单元增加10倍。瓶装和罐装啤酒，尤其是出口啤酒，需要进行巴氏杀菌。
路易斯巴斯德提出了计算灭菌单位的经验公式。产品产生的杀菌单位是时间和温度的函数。巴氏杀菌单位是指将啤酒在60℃保温1min所获得的杀菌效果为1PU值。即通过巴氏杀菌单元（PU）来衡量杀菌效果，使用巴氏杀菌单元（PU）测试仪可以准确控制杀菌单元。
PU=1.393（杀菌温度60）×杀菌时间（分钟）
根据PU值公式，可以计算出1min在不同温度下处理的PU值。灭菌单元用后续记录仪进行测量，当它通过灭菌器时，容器内外的探头会记录处理温度。啤酒的巴氏杀菌单位要求在15-25PU之间。使用的巴氏杀菌装置越小，啤酒的味道就越好。但出于安全原因，大多数啤酒厂通常将其保持在上限。

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